Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PRIM2P49643 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms