Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GTF2E1P29083 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GTF2E1P29083 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms