Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GJB2P29033 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GJB2P29033 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GJB2P29033 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms