Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRHP20396 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRHP20396 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRHP20396 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRHP20396 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRHP20396 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRHP20396 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRHP20396 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRHP20396 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRHP20396 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRHP20396 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRHP20396 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRHP20396 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRHP20396 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 METTL23-207ENST00000588783 1184 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRHP20396 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRHP20396 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRHP20396 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms