Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATF3P18847 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATF3P18847 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATF3P18847 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms