Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SFTPBP07988 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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SFTPBP07988 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SFTPBP07988 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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