Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
POLBP06746 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
POLBP06746 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
POLBP06746 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
POLBP06746 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms