Protein–RNA interactions for Protein: O94850

DDN, Dendrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDNO94850 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDNO94850 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDNO94850 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDNO94850 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDNO94850 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDNO94850 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDNO94850 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDNO94850 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms