Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
E9PBE3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
E9PBE3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
E9PBE3 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
E9PBE3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms