Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF879B4DU55 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ZNF879B4DU55 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms