Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VWA8A3KMH1 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms