Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPDC1A2A3K4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms