Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RABGEF1Q9UJ41 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RABGEF1Q9UJ41 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RABGEF1Q9UJ41 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RABGEF1Q9UJ41 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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