Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB6BQ9NRW1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB6BQ9NRW1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms