Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP29Q9HBJ7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP29Q9HBJ7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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