Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM12Q9H4Q4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms