Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM55Q9BYV6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms