Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 DIAPH2-201ENST00000324765 9333 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PMCHL2Q9BQD1 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms