Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 RASAL1-204ENST00000546530 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 IFT80-201ENST00000326448 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 MYO1F-201ENST00000338257 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ARHGAP30-203ENST00000368016 3482 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ITSN1-201ENST00000379960 3026 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 MRPS25-201ENST00000253686 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CYP2B6-201ENST00000324071 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TRAK1-202ENST00000341421 4620 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 PRDM1-201ENST00000369089 4675 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 MAP3K7-204ENST00000369329 4911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 LINC00473-205ENST00000584911 2212 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CACNG4-201ENST00000262138 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CIITA-212ENST00000618207 2844 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 PUM3-202ENST00000397885 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 IKBKB-230ENST00000629753 4069 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SLC14A2-201ENST00000255226 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 LILRB1-205ENST00000396331 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SH3RF2-201ENST00000359120 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ATP6V0A4-203ENST00000393054 3090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 GLYR1-201ENST00000321919 3772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 UNC45B-201ENST00000268876 5679 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ZNF93-205ENST00000591366 590 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SLIT2-202ENST00000503823 5233 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 RPH3A-201ENST00000389385 4679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 BRD9-204ENST00000483173 2120 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AC005324.4-204ENST00000413242 4262 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 RIPOR3-201ENST00000045083 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CTSE-201ENST00000358184 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CLNS1A-204ENST00000525428 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 MATN1-201ENST00000373765 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 PRKCQ-202ENST00000397176 3096 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 MED22-210ENST00000614493 3886 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 PLEKHG6-204ENST00000449001 3111 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 FERMT1-204ENST00000536936 3229 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
PRAC1Q96KF2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms