Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPAP2Q8IXW5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPAP2Q8IXW5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms