Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms