Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC84Q86UT8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms