Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AGAP9Q5VTM2 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms