Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
HES3Q5TGS1 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms