Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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C10orf55Q5SWW7 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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C10orf55Q5SWW7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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C10orf55Q5SWW7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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C10orf55Q5SWW7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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C10orf55Q5SWW7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
C10orf55Q5SWW7 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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