Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CSPP1Q1MSJ5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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