Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PCK2Q16822 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PCK2Q16822 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms