Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SGCAQ16586 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SGCAQ16586 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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