Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NTRK3Q16288 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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