Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PCLAFQ15004 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCLAFQ15004 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PCLAFQ15004 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCLAFQ15004 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCLAFQ15004 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCLAFQ15004 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCLAFQ15004 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PCLAFQ15004 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PCLAFQ15004 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PCLAFQ15004 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PCLAFQ15004 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms