Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CYTOR-201ENST00000331944 529 ntTSL 1 (best)14.49□□□□□ -0.095e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 FAAP100-203ENST00000443656 3822 ntTSL 1 (best)14.38□□□□□ -0.115e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CYTOR-209ENST00000423846 457 ntTSL 1 (best)14.35□□□□□ -0.115e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 DHX30-207ENST00000457607 3748 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.124e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.164e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SCAMP2-207ENST00000566480 2476 ntTSL 513.59□□□□□ -0.235e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 NELFE-205ENST00000441998 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.55□□□□□ -0.245e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CYTOR-208ENST00000419680 675 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.285e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CYTOR-210ENST00000437561 455 ntTSL 213.31□□□□□ -0.285e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CYTOR-211ENST00000455131 733 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.285e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 SCAMP2-204ENST00000563829 3162 ntTSL 213.1□□□□□ -0.315e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 TRA2B-214ENST00000487615 4485 ntTSL 1 (best)13.05□□□□□ -0.321e-20■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 DHX30-202ENST00000395745 3887 ntTSL 1 (best)12.63□□□□□ -0.394e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 TRA2B-204ENST00000414862 710 ntTSL 39.53□□□□□ -0.881e-20■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.965e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.985e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CYTOR-214ENST00000629257 323 ntTSL 57.55□□□□□ -1.25e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 TRA2B-209ENST00000466832 2414 ntTSL 26.23□□□□□ -1.411e-20■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CRLS1-207ENST00000609154 977 ntTSL 1 (best)5.65□□□□□ -1.55e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CRLS1-206ENST00000489345 644 ntTSL 55.5□□□□□ -1.535e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CYTOR-203ENST00000409139 519 ntTSL 35.41□□□□□ -1.545e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.595e-11■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.974e-7■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MRPL49-204ENST00000526319 1906 ntTSL 219.93■□□□□ 0.784e-7■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.374e-7■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MRPL49-202ENST00000524482 2065 ntTSL 214.99□□□□□ -0.014e-7■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MRPL49-207ENST00000532671 2526 ntTSL 213.21□□□□□ -0.294e-7■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-202ENST00000339290 3365 ntTSL 1 (best)19.55■□□□□ 0.723e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-214ENST00000525477 3431 ntTSL 1 (best)18.95■□□□□ 0.623e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.563e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.523e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-237ENST00000533837 3492 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.513e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.383e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-210ENST00000463282 3422 ntTSL 1 (best)17.44■□□□□ 0.383e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.383e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-204ENST00000367812 3565 ntTSL 1 (best)17.41■□□□□ 0.383e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.383e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.373e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-218ENST00000526320 3081 ntTSL 1 (best)7.35□□□□□ -1.233e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-236ENST00000533808 3349 ntTSL 1 (best)7.26□□□□□ -1.253e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-233ENST00000531845 3230 ntTSL 26.13□□□□□ -1.433e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-215ENST00000525514 3288 ntTSL 1 (best)5.77□□□□□ -1.493e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-229ENST00000529586 3203 ntTSL 1 (best)5.24□□□□□ -1.573e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.593e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-208ENST00000438901 3481 ntTSL 1 (best)4.96□□□□□ -1.623e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-220ENST00000526889 3157 ntTSL 1 (best)4.84□□□□□ -1.633e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 MYB-230ENST00000531519 2911 ntTSL 1 (best)4.79□□□□□ -1.643e-17■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 AP3M1-202ENST00000372745 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.721e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 B2M-203ENST00000557901 407 ntTSL 1 (best)9.65□□□□□ -0.865e-18■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 CD55-210ENST00000634386 951 ntTSL 57.5□□□□□ -1.211e-6■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 NOP56-205ENST00000462630 859 ntTSL 211.41□□□□□ -0.582e-23■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 NOP56-208ENST00000467857 735 ntTSL 210.08□□□□□ -0.82e-23■□□□□ 8.8
PABPC4Q13310 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.772e-13■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.363e-7■□□□□ 8.7
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PABPC4Q13310 COMMD3-BMI1-201ENST00000417470 745 ntTSL 520.73■□□□□ 0.912e-13■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 COMMD3-214ENST00000496071 1150 ntTSL 520.53■□□□□ 0.882e-13■□□□□ 8.7
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PABPC4Q13310 DDX3X-209ENST00000611968 630 ntTSL 318.64■□□□□ 0.571e-19■□□□□ 8.7
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PABPC4Q13310 COMMD3-203ENST00000448361 757 ntTSL 316.95■□□□□ 0.32e-13■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.233e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 COMMD3-205ENST00000463688 1407 ntTSL 516.32■□□□□ 0.22e-13■□□□□ 8.7
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PABPC4Q13310 ANKLE2-207ENST00000539605 10890 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.073e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 TSPYL2-201ENST00000375442 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.153e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 PPP2R5C-209ENST00000553890 492 ntTSL 313.66□□□□□ -0.223e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ANKLE2-208ENST00000542282 3302 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.343e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 PPP2R5C-212ENST00000554442 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.453e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 TSPYL2-204ENST00000556808 4178 ntTSL 210.87□□□□□ -0.673e-7■□□□□ 8.7
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PABPC4Q13310 DDX3X-202ENST00000441189 1051 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.791e-19■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 COMMD3-BMI1-205ENST00000602390 1419 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.82e-13■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 COMMD3-BMI1-203ENST00000475460 508 ntTSL 29.23□□□□□ -0.932e-13■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.993e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 COMMD3-204ENST00000456711 748 ntTSL 37.98□□□□□ -1.132e-13■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 COMMD3-212ENST00000479958 1443 ntTSL 27.58□□□□□ -1.22e-13■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 PPP2R5C-215ENST00000556068 3363 ntTSL 27.51□□□□□ -1.213e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 COMMD3-BMI1-206ENST00000602395 621 ntTSL 27.17□□□□□ -1.262e-13■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 ACLY-206ENST00000588779 783 ntTSL 36.84□□□□□ -1.312e-13■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 PPP2R5C-213ENST00000554504 448 ntTSL 36.81□□□□□ -1.323e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 COMMD3-213ENST00000483684 722 ntTSL 56.12□□□□□ -1.432e-13■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 COMMD3-BMI1-202ENST00000463409 605 ntTSL 35.99□□□□□ -1.452e-13■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.52e-13■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 HUWE1-210ENST00000474971 598 ntTSL 24.57□□□□□ -1.683e-7■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.662e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.122e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 TOMM5-202ENST00000377773 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 02e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 AL513165.2-202ENST00000541804 1514 ntTSL 1 (best)12.66□□□□□ -0.382e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 TOMM5-204ENST00000540941 3071 ntTSL 1 (best)12.42□□□□□ -0.422e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 AL513165.2-201ENST00000544475 2999 ntTSL 1 (best)12.11□□□□□ -0.472e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.813e-9■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.375e-22■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 NDUFV1-224ENST00000532343 620 ntTSL 316.9■□□□□ 0.35e-22■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.015e-22■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.225e-22■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.415e-22■□□□□ 8.7
PABPC4Q13310 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.27e-7■□□□□ 8.7
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