Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SLFN5Q08AF3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms