Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TFF3Q07654 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms