Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEUP1Q05D60 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms