Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCCD1P59942 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms