Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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FAM3BP58499 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
FAM3BP58499 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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