Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BACE1P56817 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BACE1P56817 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BACE1P56817 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BACE1P56817 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms