Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FOSBP53539 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms