Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RORCP51449 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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RORCP51449 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RORCP51449 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RORCP51449 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RORCP51449 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RORCP51449 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RORCP51449 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RORCP51449 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RORCP51449 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RORCP51449 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RORCP51449 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RORCP51449 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RORCP51449 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RORCP51449 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RORCP51449 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RORCP51449 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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RORCP51449 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RORCP51449 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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RORCP51449 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RORCP51449 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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