Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETFBP38117 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETFBP38117 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETFBP38117 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETFBP38117 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETFBP38117 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETFBP38117 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETFBP38117 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETFBP38117 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETFBP38117 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ETFBP38117 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ETFBP38117 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ETFBP38117 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms