Protein–RNA interactions for Protein: P36382

GJA5, Gap junction alpha-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA5P36382 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA5P36382 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA5P36382 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA5P36382 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA5P36382 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA5P36382 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA5P36382 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA5P36382 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA5P36382 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GJA5P36382 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GJA5P36382 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GJA5P36382 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA5P36382 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA5P36382 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA5P36382 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA5P36382 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA5P36382 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA5P36382 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA5P36382 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA5P36382 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA5P36382 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA5P36382 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA5P36382 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GJA5P36382 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms