Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TNNI3P19429 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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