Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPI1P17947 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPI1P17947 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPI1P17947 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPI1P17947 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPI1P17947 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPI1P17947 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SPI1P17947 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SPI1P17947 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SPI1P17947 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SPI1P17947 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SPI1P17947 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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