Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MTHFD1P11586 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms