Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLDN9O95484 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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CLDN9O95484 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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CLDN9O95484 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CLDN9O95484 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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