Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SIN3BO75182 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 367.6 ms