Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SLC28A2O43868 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SLC28A2O43868 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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