Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCF2LO15068 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms