Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
O00370 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
O00370 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
O00370 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
O00370 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
O00370 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
O00370 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
O00370 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
O00370 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
O00370 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms