Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HHLA1C9JL84 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms